微生物质谱鉴定系统基质辅助激光解吸电离飞机时间质谱（MALIDI-TOF）技术的出现在很大方面弥补了传统方法的不足。质谱仪具有高灵敏度、高特异性、高准确度和高通量等特点，加上其自动化和检测成本低的优势，已经逐渐在微生物各领域实验室被广泛应用。在细菌、真菌（酵母菌/丝状真菌）、分枝杆菌等微生物鉴定中发挥了重要作用。