菌落计数器是一种数字显示式自动细菌检验仪器。本仪器可减轻实验人员的劳动强度，提高工效，提高工作质量，软件系统通过图像输入设备对培养好的菌落进行数字化图像采集，经USB口数据通信传输到计算机终端计数凭条，对输入的数字图像进行一系列图像算法处理，输出计数结果，根据情况进行人工校正，计数完成后可对相关文件进行保存，将输出的数据存储在计算机中，是专为微生物实验室用户量身定做。
01、CCD传感器的等级
在选购全自动菌落计数仪时，很多用户喜欢选择高像素的，但是没有考虑到检验和科研的实际应用需求，所以用户在购买仪器前要确定好自己要买多少像素的CCD传感器。
02、图像采集通道
所谓的“图像采集通道”，是指菌落计数仪获取样本信息的能力，即仪器是否在计数前开始计数初始信息的诚实可靠。如果图像采集通道过于单一，后期计数时容易出现误判，所以“图像采集通道”指标应该是越多越好。指示剂相应时间越小，这样菌落计数仪获取样本信息的能力越强。
03、菌落分辨率
一般入门级菌落计数仪的zui小分辨率多为0.1左右，中型则为0.05mm左右。如果实际上是比较入门和机型的图形文件显示能力，配合高分辨率计数器，在菌落小的时候效果则更为明显。
04、管理功能
在选购时，一定要选择具有数据和报表管理功能的设备。因为微生物的不可重复性和以往检验数据的管理和回溯极其重要，否则实际中繁杂的统计数据和报表管理工作会耗尽科研人员精力。
05、性能指标
现在有些菌落计数仪厂家在给用户介绍时，会宣传他们的产品有多少多少功能，多高多高的指标，实际上真正买回去，根本用不到那么多功能，更重要的还是要统计菌落的实际效果好，不能为了过多的功能而买一个效果不是很好的仪器。而统计效果的好坏关键在于算法是否合理。
06、方便性
全自动菌落计数仪的使用就是减少了人工菌落计数器的工作量，减轻了工作人员的工作强度，但是由于菌落形状和样品状态的不确定性，市场上的菌落计数仪大多强调手动干预以提高准确性。所以用户在购买时应注意操作是否简单，是否符合工作人员的操作习惯和思路。一般来说，需要的人工干预越少，使用起来就越容易。
