微生物质谱鉴定采用先进的模块化设计理念，使得仪器硬件的故障率低，维护简单、方便；同时，系统采用性能先进的固态激光器，使得扫描的速度更快，激光寿命更长（为传统气态激光器的16倍以上）。它具有高通量、高质量精度、高灵敏度和高鉴定准确率等优点，经过十几年的发展和临床验证，为临床微生物学带来了一次革命性的转变。
其工作原理：
首先测得待测微生物的蛋白质指纹谱图（PMF），然后将这些指纹谱图与microTyperMS中的各种微生物标准指纹图谱库进行匹配检索，从而完成对微生物的鉴定，一台仪器便可同时检测细菌和真菌。与常规的形态学分析和分子生物学鉴定方法相比，具有速度快（只需几分钟）、操作简便、成本绝对低廉（降低10倍以上），准确度高（超过95%），并且同时可以进行同源性分析和常规的耐药性分析，广泛应用于临床微生物，包括细菌和真菌、的高通量快速鉴定、疾控中心的微生物传染病原的鉴定与监测、海关进出口商品的检验检疫、食品生产中的微生物检测工业、农业和环境中的细菌监测等领域，具有广阔的市场前景和重要的社会意义。
和传统的微生物鉴定方法相比，质谱技术鉴定微生物的优点是：
1、速度快：细菌培养后，1小时内完成数十个样本的鉴定，可以提前5-48小时出具鉴定结果；
2、成本低：质谱技术的鉴定成本是传统生化方法的一半左右；
3、鉴定结果准确，客观，无需经验丰富的专业技术人员。
微生物质谱鉴定主要应用领域：
1、临床微生物的高通量快速鉴定；
2、疾控中心的微生物传染病原的鉴定与监测；
3、检验检疫；
4、食品生产与微生物检测；
5、工业、农业和环境中的细菌检测。
